Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClmpQ8R373 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClmpQ8R373 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClmpQ8R373 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClmpQ8R373 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClmpQ8R373 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ClmpQ8R373 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClmpQ8R373 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms