Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf183Q8QZS5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rnf183Q8QZS5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf183Q8QZS5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf183Q8QZS5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf183Q8QZS5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf183Q8QZS5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf183Q8QZS5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf183Q8QZS5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms