Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Matr3Q8K310 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Matr3Q8K310 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Matr3Q8K310 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms