Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Depp1Q8K2F3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms