Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sde2Q8K1J5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sde2Q8K1J5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms