Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LgsnQ8CIX8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LgsnQ8CIX8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LgsnQ8CIX8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms