Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nav1Q8CH77 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Nav1Q8CH77 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nav1Q8CH77 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms