Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tshz3Q8CGV9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms