Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc43a2Q8CGA3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc43a2Q8CGA3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms