Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc8Q8CFD5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ercc8Q8CFD5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ercc8Q8CFD5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ercc8Q8CFD5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ercc8Q8CFD5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ercc8Q8CFD5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ercc8Q8CFD5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc8Q8CFD5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc8Q8CFD5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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