Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc28aQ8CEI3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc28aQ8CEI3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc28aQ8CEI3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms