Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc178Q8CDV0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc178Q8CDV0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc178Q8CDV0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms