Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A430089I19RikQ8C9W1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A430089I19RikQ8C9W1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms