Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsr2Q8C8T8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr2Q8C8T8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms