Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp20Q8C6M1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms