Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Rapgef5Q8C0Q9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Rapgef5Q8C0Q9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Rapgef5Q8C0Q9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Rapgef5Q8C0Q9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Rapgef5Q8C0Q9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef5Q8C0Q9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Rapgef5Q8C0Q9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Rapgef5Q8C0Q9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms