Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trerf1Q8BXJ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trerf1Q8BXJ2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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