Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rbbp5Q8BX09 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms