Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx17Q8BVL3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx17Q8BVL3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Snx17Q8BVL3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms