Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Pggt1bQ8BUY9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Pggt1bQ8BUY9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pggt1bQ8BUY9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Pggt1bQ8BUY9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Pggt1bQ8BUY9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Pggt1bQ8BUY9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pggt1bQ8BUY9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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