Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcgF3Q8BTQ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcgF3Q8BTQ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms