Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep55Q8BT07 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep55Q8BT07 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.6 ms