Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl38Q8BSF5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl38Q8BSF5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl38Q8BSF5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms