Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cc2d1bQ8BRN9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cc2d1bQ8BRN9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms