Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem87bQ8BKU8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem87bQ8BKU8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms