Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHE5

Bmp3, Bone morphogenetic protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp3Q8BHE5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bmp3Q8BHE5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bmp3Q8BHE5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bmp3Q8BHE5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bmp3Q8BHE5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bmp3Q8BHE5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bmp3Q8BHE5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bmp3Q8BHE5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms