Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubash3bQ8BGG7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ubash3bQ8BGG7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubash3bQ8BGG7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms