Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim6Q8BGE7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim6Q8BGE7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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