Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox2Q8BG99 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms