Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Srgap3Q812A2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Srgap3Q812A2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srgap3Q812A2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms