Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sestd1Q80UK0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sestd1Q80UK0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sestd1Q80UK0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms