Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf8Q80TJ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Phf8Q80TJ7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms