Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atf7ipQ7TT18 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atf7ipQ7TT18 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atf7ipQ7TT18 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms