Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnf1Q7TSH7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnf1Q7TSH7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms