Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700010I14RikQ7TPG0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700010I14RikQ7TPG0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700010I14RikQ7TPG0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms