Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp17leQ7M764 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp17leQ7M764 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp17leQ7M764 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms