Protein–RNA interactions for Protein: Q791N7

Znrd1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrd1Q791N7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znrd1Q791N7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znrd1Q791N7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znrd1Q791N7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms