Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eci3Q78JN3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eci3Q78JN3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms