Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GypcQ78HU7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GypcQ78HU7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms