Protein–RNA interactions for Protein: Q76KF0

Sema6d, Semaphorin-6D, mousemouse

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6dQ76KF0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6dQ76KF0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6dQ76KF0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms