Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssh1Q76I79 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssh1Q76I79 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms