Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnih3Q6ZWS4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnih3Q6ZWS4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms