Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
March6Q6ZQ89 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
March6Q6ZQ89 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March6Q6ZQ89 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms