Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx55Q6ZPL9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx55Q6ZPL9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx55Q6ZPL9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms