Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cxcl3Q6W5C0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcl3Q6W5C0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl3Q6W5C0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms