Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Rhox8Q6VSS7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rhox8Q6VSS7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rhox8Q6VSS7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Rhox8Q6VSS7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Rhox8Q6VSS7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Rhox8Q6VSS7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Rhox8Q6VSS7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Rhox8Q6VSS7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Rhox8Q6VSS7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Rhox8Q6VSS7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Rhox8Q6VSS7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rhox8Q6VSS7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rhox8Q6VSS7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms