Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casc1Q6TDU8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc1Q6TDU8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms