Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q899

Ddx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, mousemouse

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Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx58Q6Q899 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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Ddx58Q6Q899 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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Ddx58Q6Q899 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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Ddx58Q6Q899 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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Ddx58Q6Q899 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx58Q6Q899 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx58Q6Q899 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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