Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bms1Q6PGF5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bms1Q6PGF5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bms1Q6PGF5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms