Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrm2bQ6PEE3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrm2bQ6PEE3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms